Crossovery

Rodney McKay se poprvé objevil jako vedlejší postava v SG-1, kde soupeřil se Samanthou Carter. Jeho přesun do hlavní role v Atlantis byl jedním z nejúspěšnějších crossoverů celé franšízy.

V sezóně 4 Atlantis přebírá velení expedice plukovnice Samantha Carter po zmizení Elizabeth Weir. Amanda Tapping tak hrála hlavní roli v obou seriálech současně.

Daniel Jackson navštívil Atlantidu ve dvoudílné epizodě First Contact / The Lost Tribe. Společně s McKayem objevil laboratoř Janus a Attero zařízení.

Robert Picardo hrál Woolseyho nejprve jako byrokratického antagonistu v SG-1, pak jako velitele Atlantidy v sezóně 5. Jeho vývoj je jedním z nejlepších charakterových oblouků.

Teal'c a Ronon Dex se setkávají na Midway stanici. Dva největší válečníci Stargate univerza se nejprve střetnou, ale nakonec spolupracují při obraně stanice před Wraithy.

Jack O'Neill je přítomen při schválení a startu expedice Atlantis v pilotní epizodě Rising. Richard Dean Anderson se v Atlantis objevil několikrát.

Program Stargate a SGC hrají důležitou roli i v Universe. Komunikační kameny umožňují posádce Destiny kontaktovat Zemi.

Rodney McKay se krátce objevuje v Universe, kde pomáhá s technickými problémy souvisejícími s Destiny na dálku.

Seriály SG-1 a Atlantis se vysílaly souběžně a sdílely časovou linii. Události v jednom seriálu měly dopad na druhý.

Celovečerní filmy Ark of Truth a Continuum slouží jako epilog SG-1 a propojují příběhové linie.

Jack O'Neill osobně schvaluje expedici Atlantis a je přítomen při aktivaci osmého chevronu. Předává velení Dr. Elizabeth Weir a loučí se s členy expedice.

Rodney McKay se poprvé objevil v SG-1 jako arogantní vědec soupeřící se Samanthou Carter. Jejich rivalita se stala základem pro jeho pozdější hlavní roli v Atlantis.

Daniel Jackson navštíví Atlantidu kvůli výzkumu laboratoře Janus. Společně s McKayem objeví Attero zařízení a jsou uneseni kmenem Vanir (degenerovaných Asgardů).

Po odchodu Elizabeth Weir přebírá velení Atlantidy plukovnice Samantha Carter na celou čtvrtou sérii. Amanda Tapping tak hraje hlavní roli v obou seriálech současně.

Teal'c a Ronon Dex se setkávají na Midway stanici. Dva největší válečníci Stargate univerza se nejprve střetnou, ale nakonec spolupracují při obraně stanice před Wraithy.

Po navázání kontaktu se Zemí pravidelně zásobuje Atlantidu loď Daedalus. SGC poskytuje personál, vybavení a zpravodajské informace pro expedici v galaxii Pegasus.